Program Doktor Ilmu Farmasi (PSDIF) Fakultas Farmasi USU didirikan pada tahun 2009 yang diselenggarakan sesuai dengan Keputusan Menteri Nomor 212/U/1999 tentang Pedoman Penyelenggaraan Program Doktor.
PSDIF didukung oleh sarana dan prasarana yang baik dan staf pengajar yang ahli dibidangnya. Penelitian di PSDIF dapat dibagi berdasarkan bidang Farmakologi, Farmasi Klinis dan Komunitas, Farmasetika, Biologi Farmasi dan Kimia Farmasi. Hasil penelitian yang diperoleh oleh dosen dan mahasiswa di program ini telah berhasil dipublikasikan di jurnal internasional bereputasi.
Saat ini PSDIF telah berhasil memperoleh akreditasi B. Gelar Doktor diberikan setelah promovendus menunjukkan penguasaan pengetahuan secara mendalam dalam bidang Ilmu Farmasi, yang ditujukkan dengan kemampuan dan ketrampilan meneliti secara mandiri. Hasil penelitian harus menunjukkan kebaruan (Novelty) yang dipublikasikan di jurnal internasional bereputasi yang diharapkan dapat menambah khasanah ilmu pengetahuan dan memberikan solusi baru terhadap permasalahan dibidang kesehatan khususnya dibidang kefarmasian.